Bioinformatique Avec Python et Biopython

Par (auteur) Jaspard, Emmanuel
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Par (auteur) Jaspard, Emmanuel; Par (auteur) Hunault, Gilles
Description:
La bioinformatique est une discipline essentielle de la biologie. L’objectif de  cet ouvrage est de montrer par l’exemple des scripts Python et Biopython et  d’établir un lien avec le concept biologique afférent, afin que le lecteur puisse  développer ses propres scripts ou adapter ceux existants.
Le langage Python, par sa simplicité d’apprentissage, est particulièrement  utilisé pour développer des applications. Biopython est un ensemble de scripts  et d’outils, librement disponibles, permettant de développer des bibliothèques et  des applications Python pour les besoins des travaux en bioinformatique.

Table of contents:
  • Dénombrement des nucléotides et calculs associés.
  • Écriture de séquences d’acides nucléiques.
  • Séquences et expressions régulières.
  • Recherches bibliographiques dans PubMed.
  • Profil PFAM d’une famille de protéines.
  • Profil d’hydrophobicité d’une protéine – fenêtre de taille variable.
  • Position de cystéines impliquées dans un pont disulfure.
  • Calcul du barycentre d’une chaîne polypeptidique repliée.
  • Diagrammes de Ramachandran.
  • Contacts entre résidus d’acides aminés dans les structures 3D.
  • Superposition de structures protéiques.
  • Les protéines ou régions intrinsèquement désordonnées.
  • Alignements avec BLAST de séquences et protéines homologues.

Plus d'infos
Auteur Par (auteur) Jaspard, Emmanuel
Date de publication 3 janv. 2024
EAN 9782100858873
Contributeurs Jaspard, Emmanuel; Hunault, Gilles
Éditeur Dunod
Langues Français
Largeur 169 mm
Hauteur 240 mm
Epaisseur 13 mm
Format du Produit Couverture souple
Poids 0.390000
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